Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Slc18a3O35304 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms