Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ArxO35085 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ArxO35085 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ArxO35085 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ArxO35085 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ArxO35085 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ArxO35085 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ArxO35085 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ArxO35085 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ArxO35085 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ArxO35085 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ArxO35085 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ArxO35085 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ArxO35085 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ArxO35085 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms