Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sypl1O09117 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms