Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx2O08686 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barx2O08686 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Barx2O08686 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms