Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sec22bO08547 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Sec22bO08547 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec22bO08547 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22bO08547 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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