Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp35M0QWN7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms