Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm8888J3QPX5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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