Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm2035J3QP87 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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