Protein–RNA interactions for Protein: J3QP80

Gm5814, MCG15559, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5814J3QP80 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5814J3QP80 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5814J3QP80 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms