Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms