Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim18J3QNP2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim18J3QNP2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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