Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms