Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm11236J3QMS7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms