Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
7530416G11RikJ3QJX6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
7530416G11RikJ3QJX6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms