Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcf11G3X9Z4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcf11G3X9Z4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms