Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chrna9G3X8Z7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms