Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Srp72F8VQC1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Srp72F8VQC1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Srp72F8VQC1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Srp72F8VQC1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Srp72F8VQC1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Srp72F8VQC1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Srp72F8VQC1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Srp72F8VQC1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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