Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LctF8VPT3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms