Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Arid4aF8VPQ2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms