Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
H2-M1F7CXU4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
H2-M1F7CXU4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms