Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rarres1F6ZIS7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rarres1F6ZIS7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rarres1F6ZIS7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rarres1F6ZIS7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rarres1F6ZIS7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rarres1F6ZIS7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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