Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm6619F6URP1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm6619F6URP1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms