Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lmod3E9QA62 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms