Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cald1E9QA15 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms