Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms