Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ryr1E9PZQ0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms