Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc62E9PVD1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc62E9PVD1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms