Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc170D3YXL0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms