Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Samd1D3YXK1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd1D3YXK1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms