Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 1,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzd8B9EJ80 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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