Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cyp26c1B2RXA7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyp26c1B2RXA7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms