Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprbB2RU80 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PtprbB2RU80 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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