Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Znf518aB2RRF6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Znf518aB2RRF6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms