Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms