Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms