Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FocadA2AKG8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FocadA2AKG8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms