Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ambra1A2AH22 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ambra1A2AH22 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms