Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
4930447F04RikA2AFR2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
4930447F04RikA2AFR2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.2 ms