Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vstm4T1NXB5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms