Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms