Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms