Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PapolbQ9WVP6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms