Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme3Q9WV85 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms