Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apobec2Q9WV35 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apobec2Q9WV35 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms