Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnip1Q9WUU8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms