Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trpv2Q9WTR1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms