Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rfwd2Q9R1A8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfwd2Q9R1A8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms