Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plod1Q9R0E2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms