Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lamc3Q9R0B6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc3Q9R0B6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms