Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp21Q9QZL6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp21Q9QZL6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms